Otot ikan dikenal sebagai lingkungan rendah oksigen, jadi Henneguya salminicola mungkin hanya beradaptasi untuk menghasilkan energinya dengan cara lain.Apa sebenarnya yang menggerakkan parasit mikroskopis alih-alih oksigen tetap menjadi misteri yang belum dipecahkan oleh para ilmuwan.
Meskipun citra mikroskopis mengungkapkan organel terkait mitokondria yang mempertahankan beberapa karakteristik fisik organ asli, mereka tidak memiliki semua informasi genetik yang biasanya terkait, yang menunjukkan bahwa parasit tidak lagi mampu melakukan respirasi aerobik standar.Beberapa peneliti percaya bahwa Henneguya salminicola entah bagaimana bisa menarik energi dari sel-sel salmon di sekitarnya, yang lain mengatakan bahwa itu mungkin mampu bernapas tanpa oksigen.
Ada juga beberapa komunitas ilmiah yang membantah fakta bahwa organisme ini dapat menghabiskan seluruh hidupnya tanpa oksigen.
Terlepas dari kontroversi seputar kemampuan parasit untuk bertahan hidup tanpa oksigen, tidak dapat disangkal bahwa penemuannya telah mengubah cara kita memandang evolusi.