Selain buku, Prof Azra juga rutin menulis kolom di beberapa media Tanah Air.
Prof Azra pernah menjabat sebagai Rektor UNI Syarif Hidayatullah Jakarta antara 1998 hingga 2006.
Salah satu bukunya yang paling banyak dirujuk adalah Jaringan Ulama yang terbit pertama pada 1994.
Buku Jaringan Ulama berusaha mencari benang merah jejaring ulama Haramain dan Nusantara sebelum abad ke-19.
Banyak sumber berbahasa Arab yang dipakai Prof Azra dalam menyusun buku yang berasal dari desertasi S3-nya.